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Docker Kubernetes Mastodon Ubuntu

MastodonをDocker Compose環境から、Kubernetes環境にお引っ越しした

今まで数年間、Ubuntuで立てたシングルノードのDocker Compose上でMastodonを動かしていたのだが、世の中の流れに合わせてKubernetes上に移動させた。

docker-compose.ymlから自動的にKubernetesのマニフェストファイルに変換してくれるコマンドもあるけども、勉強のために手動で1個ずつ置き換えていった。

出来上がったk8s上のMastodon構成

PostgreSQLのデータをNFS上に移動する

元々はDocker Composeのローカルストレージ上に置いていたPostgreSQLのデータをNFSの共有ディレクトリに移動させた。

  1. NFSサーバーでディレクトリを共有する
  2. 共有ディレクトリ上で新DBを初期化する
  3. 移行元のDBサーバーでpg_dumpコマンドを用いてデータをエクスポートする
  4. 新DBでエクスポートしたデータをインポートする

同じCPUアーキテクチャ&バージョンであればDBのデータディレクトリをまるごとNFS上に持って行くだけでもデータベース移行出来るのだが、今回はDBバージョンが異なるのと、このタイミングで複数のDBを統合していたのを用途ごとに分割したかったので、上記のようなエクスポート&インポートを用いている。

このとき、Docker Compose上から書き込んでいたデータが、Kubernetes上のプロセスから読めないエラーメッセージが多発したので、NFSのマウントオプションでバージョン3を使う`mountOptions: nfsvers=3`にして回避した。
※NFSv4のACLベースのアクセス権の考え方に引っかかっていた模様。NFSv3まではrwxビットだけなので。。。

apiVersion: v1
kind: PersistentVolume
metadata:
  name: postgres-mstdnblue
  annotations:
    name: postgres-mstdnblue
spec:
  capacity:
    storage: 50Gi
  accessModes:
    - ReadWriteOnce
  mountOptions:
    - nfsvers=3
  nfs:
    server: 192.168.8.253
    path: /mnt/tank/share/nfs/k8s/postgres-mstdnblue-data

PV/PVCを作る

NFSv3の共有ディレクトリをPodに引き渡すためのPVCであるが、大規模環境だとサイズや速度などで階層化しつつ均一なボリュームをまとめて作って適切にPVCで引きこむような設計をすると想像する。(その方がストレージ設計者とコンピューティングリソースの提供者の役割分担がはっきりしやすい&下のレイヤーを隠蔽しやすい)

ただ、今回の個人用の環境だとどこにどのデータがあるかはっきりしたほうが良いので、NFSディレクトリの名前とannotationsを1対1で対応させてどのPVがどういうデータを持っていて、それをどのPVCで引きこむのか分かりやすいようにしている。

名前でストレージ領域の用途が分かりやすくしたPV
名前が体を表す的なPVC

複数のテナントが相乗りするような環境だとPVが再利用されないようにしたり、データの隠匿/暗号化/リサイクル時の確実な消去なども求められるだろうなとも思ったがスルー。

Redisの移行を考える

MastodonのRedis上には他の連合(フェデレーション)を結んでいるサーバーとのトゥートの伝搬等のキューイング情報やジョブ実行状態、ユーザーが最初にアクセスしたときのホームタイムラインなどのキャッシュが保持されている。

今回は御一人様インスタンスでキャッシュやジョブ状態は飛んでしまって構わないとしたので、Redisの情報は引き継いでいかないことにした。

ConfigMapに環境変数を持ち込む

Docker Composeだとini形式(変数名=値が並んだテキストファイル)で各種プロセスに引き渡す環境変数を持っていたが、KubernetesだとConfigMapなりSecretなりにする必要がある。

地道にYAML形式に書き直すことも考えたが、面倒くさかったのでいい手がないか調べたらこんな手順が。

$ kubectl create configmap key-value-sample -n configmap-example --from-env-file=sample.ini

上記のコマンドを使ってConfigMapを作成したらenvFromでPodに引き渡すことが出来る。

v1.6 で追加された envFrom

v1.6.0 で下記のように envFrom という項目で ConfigMap または Secret の内容を一度に同名または prefix 付きの環境変数として読み込むことができようになりました。

Kubernetes: ConfigMap / Secret の内容を一度に環境変数として読み込む (envFrom)

https://qiita.com/tkusumi/items/cf7b096972bfa2810800

Mastodonの各種プロセスを起動する

Sidekiq/Streaming/Webのセットはほとんど一緒で、/mastodon/public/systemを共有しながら、bundleなりnodeでプログラムが動いている感じの構成になる。

DeploymentでNFS上のボリュームをマウントしたPodを起動して、外部公開するWebsocketなりHTTPなりのサービスエンドポイントをServiceとして定義してやれば良い。

apiVersion: apps/v1
kind: Deployment
metadata:
  name: web-mstdnblue
  labels:
    app: web-mstdnblue
spec:
  selector:
    matchLabels:
      app: web-mstdnblue
  strategy:
    type: Recreate
  template:
    metadata:
      labels:
        app: web-mstdnblue
    spec:
      hostname: web-mstdnblue
      subdomain: local
      containers:
      - image: tootsuite/mastodon
        name: web-mstdnblue
        command: ['bash']
        args: ['-c','rm -f /mastodon/tmp/pids/server.pid; bundle exec rails s -p 3000 -b 0.0.0.0']
        envFrom:
          - configMapRef:
              name: configmap-mstdnblue
        volumeMounts:
        - name: mastodon-public-mstdnblue
          mountPath: /mastodon/public/system
        envFrom:
          - configMapRef:
              name: configmap-mstdnblue
      volumes:
      - name: mastodon-public-mstdnblue
        persistentVolumeClaim:
          claimName: mastodon-public-mstdnblue-pvc
---
apiVersion: v1
kind: Service
metadata:
  name: web-mstdnblue
spec:
  type: LoadBalancer
  selector:
    app: web-mstdnblue
  ports:
  - protocol: TCP
    port: 3000
    targetPort: 3000

最終的なマニフェスト構成

たぶん、ちゃんとした管理者のいる環境だとPVとPVC あたりに管理者の分担や責任分界線が出てきそう。

それ以外はプロセスの種類ごとに分けてはみたものの、Serviceあたりでアプリケーションエンジニアとネットワークエンジニアの縄張り争いが出そうだなとも思った。

マニフェストファイルの分け方には流儀があると感じた

まとめ

Kubernetes環境にアプリケーションを持って行くとしたら、元々Docker前提で綺麗に分かれているものでもそれなりに技量がいる。

もしもレガシーなアプリケーションを持ち込むとしたら作り直した方が早いという言説にも頷ける。

AWS上のALBから、自宅環境のKubernetesクラスターまでトラフィックを持ち込んでいるところはこの記事では省略したがTailscaleを使っていたりする。そのうち書きたい。

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Docker

Docker-composeを使ってWordPressを公開する

WordPressを動かすApache HTTPd & PHP環境と、DBであるMySQLをセットでDocker-composeを利用して準備する手順。

docker-compose.yml を用意する。

version: '3.1'
services:
  blogdb:
    image: mysql:5.7
    restart: always
    environment:
      MYSQL_DATABASE: blogdb
      MYSQL_USER: blogdb
      MYSQL_PASSWORD: blogdb
      MYSQL_RANDOM_ROOT_PASSWORD: '1'
    volumes:
      - ./mysql:/var/lib/mysql

  wordpress:
    image: wordpress
    restart: always
    ports:
      - "8080:80"
    environment:
      WORDPRESS_DB_HOST: blogdb
      WORDPRESS_DB_USER: blogdb
      WORDPRESS_DB_PASSWORD: blogdb
      WORDPRESS_DB_NAME: blogdb
    volumes:
      - ./html:/var/www/html
      - ./php.ini:/usr/local/etc/php/conf.d/php.ini

wordpressコンテナのvolumesでは、以下の2つの箇所を永続化している。

file_uploads = On
memory_limit = 500M
upload_max_filesize = 500M
post_max_size = 500M
max_execution_time = 600

後は、docker-compose up -d して、適当にWordpressのセットアップをすれば良い。